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一些常用的序列处理脚本/工具 TBA

Fasta_Header_Rename.py

Turn header line to: >new_header_1, >new_header_2,...

Fasta_Header_Rename.py  <input_file.fa>  <output_file.fa>  <new_header>

re提取字符串括号内的内容

参考: https://www.jianshu.com/p/e556fa43e4e1

import re

pattern = re.compile(r'[(](.*?)[)]', re.S)  #最小匹配() -- 第一对()
pattern = re.compile(r'[(](.*)[)]', re.S)   #贪婪匹配() -- 最外围一对()
pattern = re.compile(r'\[(.*?)\]', re.S)    #最小匹配[]
pattern = re.compile(r'\[(.*)\]', re.S)     #贪婪匹配[]

re.findall(pattern, mystr)

C# String v.s. Char

String ss = "ss"
Char cc = 'cc'