TBA
Chip-seq
设计针对目标蛋白的抗体,提取目标蛋白、得到与目标蛋白结合的DNA序列。每次只能针对一个目标蛋白。
使用ATAC-seq得到全基因组范围内的TFBS后,可结合Chip-seq进行验证
常见的目标蛋白是 TF 或者 Histone
Pipeline
空白对照:input DNA(不含抗体捕获), mock IP DNA(不含抗体)
peak-calling ---> 减去背景噪音(空白对照) ---> UCSC基因浏览器
TBA
设计针对目标蛋白的抗体,提取目标蛋白、得到与目标蛋白结合的DNA序列。每次只能针对一个目标蛋白。
使用ATAC-seq得到全基因组范围内的TFBS后,可结合Chip-seq进行验证
常见的目标蛋白是 TF 或者 Histone
空白对照:input DNA(不含抗体捕获), mock IP DNA(不含抗体)
peak-calling ---> 减去背景噪音(空白对照) ---> UCSC基因浏览器