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TBA

Chip-seq

设计针对目标蛋白的抗体,提取目标蛋白、得到与目标蛋白结合的DNA序列。每次只能针对一个目标蛋白。
使用ATAC-seq得到全基因组范围内的TFBS后,可结合Chip-seq进行验证

常见的目标蛋白是 TF 或者 Histone

Pipeline

空白对照:input DNA(不含抗体捕获), mock IP DNA(不含抗体)

peak-calling ---> 减去背景噪音(空白对照) ---> UCSC基因浏览器