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Interesting Talks

一些讲座话题

GxE analysis

忘记 GWAS 是否将 Gene-Env 也纳入回归模型 （之前好像只是数据分层？），但很明显 Gene / Env 并不总是互相独立 (e.g.正常人能接受的饮食，PAH退化的病人不能接受)

GxE

一些全基因组范围的 GxE 模型，只是由 GxE Heritability 解释的 variance 只有 1-10%（最高也不到其 G Heritability 解释的一半）

GxE

作者认为，h(GxE) 有很大一部分被计入 h(G)，他们做了一个实验：模拟一个只有 GxE 作用存在的数据集，然后用统计学模型进行回溯。结果：仅有一小部分 variance 被 h(GxE) 解释

GxE

以上的 G 不仅可以是单个 Gene，也可以是 PGS 或 Pathway-specific，一些研究也会关心 GxE 发生在哪些 Gene/loci/功能 中

注，PGS/PRS (Polygenic Risk score, 与某性状相关的一组loci的作用之加权和)，可查询 PGS Catalog 数据库 及参考 GWASLab 系列讲解