BS seq
- BS-seq:Bisulfate(BS)处理DNA序列后,可将暴露状态的C变成U(再一轮复制后变成T),而甲基化的C则不受改变
- WGBS:用 BSMAP 将全基因组BS-seq测序数据 map 至 参考基因组上,可得到全基因组水平的甲基化信息
- RRBS:富含 CCGG 位点的DNA片段后再BS-seq测序、map... (高性价比)
- Chip:Illumina提供Infinium 芯片,以bp分辨率检测CpG位点;GenomeStudio软件可对Illumina芯片平台生成的数据进行可视化与分析
分析工具:Bismark